高企过期了还能追讨补助？企业如何避坑？

广东某甲公司2019年拿到高企资格，2021年底资格到期。本以为这事翻篇了，没想到2024年，省科技厅、财政厅、税务局联合发文，直接取消了它的高企资格，还要求退回之前拿的补助。

某甲公司不服，告了这三个部门，理由挺充分：

• 1. 我们的研发费用是达标的，你们认定事实错了；而且没给我们听证，程序违法；

• 2. 之前市科技局已经让我们退补助了，现在又来处理，属于重复处理；

• 3. 追讨补助是民事纠纷，不是行政部门该管的事；

• 4. 资格2021年就过期了，现在处理已经过了时效。

结果法院一审就驳回了某甲公司的全部诉求，认定三个部门的处理没问题。关键原因就两点：

① 经审计复核，公司2016-2018年（申报高企的关键年份）的研发费用占比只有3.38%，没达到“年收入5000万以下企业研发费用占比不低于5%”的硬性要求，本身就不该拿到高企资格；

② 公司提的“时效过了”“重复处理”等理由都不成立——法律没规定取消高企资格有追诉时效，哪怕资格过期，只要发现认定时不合规就能处理；市科技局追补助和省部门取消资格是两回事，不算重复。

最终，某甲公司不仅没能保住资格，还要承担50元案件受理费，之前拿的35万补助也得退回。

二、案例划重点：这4个误区企业一定要避开

这个案例看着是个例，但背后暴露的误区，很多企业都可能有。结合2025年高企审查的严趋势，这几个关键点必须记牢：

误区1：高企资格过期就“万事大吉”——真相是，资格过期不代表“既往不咎”。行政部门只要发现企业当年申报时不符合条件，哪怕过了好几年，也能取消资格、追讨优惠和奖补。

误区2：取消资格必须听证——真相是，目前没有法律规定取消高企资格需要组织听证，只要部门履行了告知、听取陈述申辩、专家复核等程序，就不算程序违法。

误区3：不同部门追补就是重复处理——真相是，“取消高企资格”是对资质的否定，“追讨补助”是对违规所得的追回，哪怕是不同部门发起，性质不同就不算重复。

误区4：研发费用“差不多就行”——真相是，研发费用占比是高企认定的核心硬指标，现在审查会通过多部门数据比对、专家复核等方式严格核查，想“凑数”根本行不通。

三、重要提醒：2025高企审查再升级，企业做好这5点避坑

数据显示，近两年全国有超7000家高企被撤销资格，2025年以来已有3500多家被“摘牌”，研发费用不达标、高新收入占比不够是主要原因。随着审查从“数量扩张”转向“质量深耕”，多部门联合监管、大数据核查成为常态，企业必须摒弃“重申报、轻维护”的思维，做好这5点：

1. 研发费用要“实”，更要“规范”——建立研发费用专账核算，设置三级明细科目，每季度自查占比是否达标（年收入5000万以下不低于5%）；留存好立项报告、工时记录、设备使用日志等佐证材料，确保数据可追溯。

2. 资格存续期别“躺平”——哪怕拿到高企资格，也要持续维护：定期梳理研发项目进展、更新知识产权布局，避免出现专利失效、研发人员社保不符等问题；每年按时填报企业年度发展情况报表，别因小疏忽丢了资质。

3. 政策红线别触碰——不要为了申报刻意“包装”：比如突击计提研发费用、将无关收入计入高新收入、短期外聘人员充抵科技人员等，这些行为在大数据核查下很容易被发现，后果是取消资格+补缴税款+滞纳金，损失惨重。

4. 证据链要“完整闭环”——研发活动要全留痕，从立项、实验记录、样品试制，到知识产权申请、成果转化销售，每个环节都要留存好相关材料（如检测报告、销售合同、产学研合作协议等），避免因“证据不足”被认定为违规。

5. 提前规划，拒绝“临时抱佛脚”——高企申报和维护是系统性工程，建议至少提前6个月梳理相关数据，重点核对“知识产权-研发项目-高新收入-人员配置”的一致性；复杂领域可委托专业机构协助，但要全程参与，避免“材料与实际脱节”。

最后再强调一句：高企资质的核心价值是“实质创新”，政策红利是对真正创新企业的激励。与其花心思“钻空子”，不如把精力放在真实研发和技术升级上，这才是企业长久发展的根本。